Анализ тканевого микроокружения (ТМО) методами многомерной гистологии с пространственным контекстом и применением искусственного интеллекта (ИИ) создает новый уровень информативности в оценке биосовместимости тканеинженерных конструкций. Современные методы пространственного профилирования (макро-/микродиссекция, баркодирование, оптическая визуализация, масс-спектрометрическая визуализация) различаются по разрешению, мультиплексности и типу анализируемых маркеров. Мультиплексная иммунофлуоресценция как одна из основ пространственной протеомики среди других методов оптической визуализации обладает рядом преимуществ, включая высокую чувствительность, сохранение структурно-биологических параметров тканевой организации и достоверную объективность при детекции фенотипа клеток в контексте гистоархитектоники. Интеграция ИИ в анализ гистосканов позволяет автоматизировать сегментацию, классификацию и картирование клеток, межклеточного взаимодействия и статистический анализ. Таким образом, пространственные технологии анализа ТМО открывают новые возможности в исследовании биосовместимости тканеинженерных конструкций для разработки трансляционных маркеров и эффективности терапии в персонализированной медицине.